Affichage protéine-protéine et protéine-ligand interactions sous forme de graphiques (réseaux), où biomolécules sont représentées comme des nœuds et leurs interactions sont représentés comme des liens, est une approche prometteuse pour l'intégration des résultats expérimentaux provenant de différentes sources pour parvenir à une compréhension systématique des mécanismes moléculaires entraînement phénotype cellulaire. L'émergence de réseaux de signalisation à grande échelle fournit une opportunité pour l'analyse statistique topologique, tandis que la visualisation de ces réseaux représente un défi. SAVI met en œuvre des procédés standard pour calculer le regroupement, la distribution de la connectivité et de détection, ainsi que la visualisation, de motifs de réseau. En outre, SAVI génère un site web complet à partir de jeux de données réseau au format texte. SAVI contient un outil appelé PathwayGenerator. Cet outil crée des cartes de connexion en tant que pages Web à partir de grandes tables décrivant les interactions de signalisation cellulaire. SAVI peut également créer des réseaux à partir de listes de noms gène / protéine
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Exigences :..
Windows (toutes)
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