compsort

outil de ligne de commande pour la comparaison de fichiers de données séparés par des virgules utilisant les différences par rapport à déterminer les conformations les plus similaires. Compsort compare les fichiers de données utilisant la différence relative, calcule un score de similarité, trie les scores dans l'ordre croissant (valeurs inférieures représentent une plus grande similitude), enregistre un nombre X de faibles scores.
Les fichiers de données produits par l'utilisateur, doivent être par des virgules fichiers texte délimité. Chaque fichier représente une molécule unique. Chaque ligne dans un fichier représente une conformation unique de la molécule. La première colonne dans le fichier de données doit être une étiquette unique à la conformation représentée par la ligne. Le reste des colonnes sont descripteurs numériques, tels que les mesures spatiales de distance.
Les lignes sont comparés combinatoire entre les fichiers. Les étiquettes de comparaison sont enchaînés et enregistrés avec les scores pour l'ensemble de lignes. Cela fournit un moyen d'identifier les conformations qui ont produit un score de similarité donné.

Les travaux futurs comprend:

• ajouter interface graphique
• Papier poster sur mon algorithme de modélisation 3D de pharmacophore
• Une version parallèle en utilisant MPI

Ce qui est nouveau dans cette version:

• fixe quelques mineure avertissements du compilateur
  
• Ajout de rapports de temps de calcul pour ensemble de calculs combinatoires en plus le temps de tri indiqué précédemment
  
• l'augmentation du niveau du binaire
optimisation du compilateur

Exigences :

Mac OS X 10.3