CLC Sequence Viewer crée un environnement logiciel permettant aux utilisateurs de faire un grand nombre d'analyses bioinformatiques, combinée à une gestion de données lisse, et d'excellentes options de visualisation graphique et de sortie.
Ce qui est nouveau dans ce libérer:
Les nouvelles fonctionnalités et améliorations
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Toutes les communications de serveur NCBI est maintenant cryptée. (NCBI se déplacera tous les services Web au protocole HTTPS le 30 Septembre, 2016). & Nbsp;
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La liste des enzymes pré-installés dans l'atelier & nbsp; a été mis à jour rebasage.
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l'outil de lancement rapide se trouve maintenant dans le menu Toolbox au lieu du menu Affichage et un bouton appelé lancement qui met en place cet outil a été ajouté à la barre d'outils.
- L'option "est pas dans la liste" a été introduit comme une nouvelle option de filtrage de table.
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Le "Tri dossier" outil utilise désormais un tri numérique pour les noms de fichiers préfixé avec un certain nombre.
- Les nouveaux espaces réservés sont disponibles pour définir les noms des sorties exportateur: & nbsp; {User}, & nbsp; {host}, et pour les éléments de l'horodatage de l'objet de sortie, {année}, & nbsp; {mois}, & nbsp; {jour}, & nbsp; {heure, & nbsp; {minute}, & nbsp; . {second} & nbsp;
- Placeholders dans les noms de sortie d'exportation qui étaient auparavant disponibles uniquement sous forme de chiffres peuvent maintenant être spécifiés en utilisant des noms écrits: {entrée} est un synonyme de {1}, {prolongation} est un synonyme pour {2} et {counter} est synonyme de {3}.
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GenBank import permet désormais aussi pour les noms de fichiers avec l'extension 'GBFF'.
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Lire les détails du groupe sont maintenant affichés sur la vue Element Infos de listes de séquence.
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Correction d'un problème rare où certaines annotations pourraient , mais n'a pas nécessairement, aller manquant sur & nbsp; séquences avec plus de 1000 annotations d'un type donné sur cette séquence avant la suppression et où le contexte option de menu contextuel de clic "Supprimer la sélection" a été utilisé. & nbsp;
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Correction d'un bug dans l'assistant "Gérer enzymes" qui a empêché un utilisateur d'annuler l'action si "Sauf nouvelle liste d'enzyme" a été activée.
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Correction d'un problème avec l'outil d'importation de métadonnées où, si une feuille de calcul avait déjà été chargé, puis en sélectionnant à nouveau la même feuille de calcul n'a pas recharger le contenu de la feuille de calcul.
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Correction d'un problème où il a fallu beaucoup de temps pour ouvrir un établi qu'il était & nbsp; previouslyclosed lors de l'affichage d'un éditeur de table ouverte qui avait été triés. & nbsp;
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Correction d'un problème où un clic droit sur un graphique dans un rapport et en choisissant pour voir "rapport", "Histoire" ou "Element info" a déclenché une erreur.
- Divers corrections mineures .
Ce qui est nouveau dans la version 7.7:
- Toutes les feuilles Excel dans un document sont maintenant importées et chaque feuille a une table créée pour son contenu.
- Le CSV, HTML et Excel tableau / tableau exportateur utilisent maintenant "Inf "et" NaN "valeurs pour remplacer l'ambigu"? ".
- dans l'assistant de l'exportation d'un tableau au format CSV, lorsqu'ils ne sont pas l'exportation de toutes les colonnes, il est maintenant possible d'annuler ou de revenir à la précédente étape tandis que les colonnes sélectionnées sont en cours de chargement. & nbsp;
- paramètres d'impression identiques peuvent maintenant être appliquées pour plusieurs rapports en une seule exportation. & nbsp;
- La "Gestion des ressources" onglet a été retiré de . le le gestionnaire de plug-in
Ce qui est nouveau dans la version 7.6.1:
Correction de bugs
- Correction d'un problème où certaines opérations de filtrage, tels que "ne contient pas" n'a pas agi correctement lors du filtrage des cellules de tableau qui contenaient plusieurs éléments d'information.
- Correction un problème où les annotations qui ont enjambé les extrémités d'une séquence circulaire seraient mal placés dans la séquence circulaire View.
- Correction d'un bug qui faisait que le plan de travail pour geler si certaines séquences ont été affichés dans la vue circulaire avec un rendu radial étiquettes.
- Correction d'un problème où certaines opérations de filtrage, tels que "ne contient pas" n'a pas agi correctement lors du filtrage des cellules de tableau qui contenaient plusieurs éléments d'information.
- Correction d'un problème qui empêchait un dossier racine sur les lecteurs Windows d'être utilisé comme un emplacement de fichier.
- Correction d'un problème où la mise à jour d'une installation existante sur Windows entraînerait le fichier .vmoptions étant supprimé, ce qui rend la course de Workbench avec le . configuration par défaut de Java
Ce qui est nouveau dans la version 7.6:
Les nouvelles fonctionnalités et améliorations
- A Molecule Viewer 3D est maintenant disponible pour la visualisation des protéines, ARN, ADN, et les petites molécules.
- Amélioration des rapports d'erreurs liées à l'espace disque faible.
- Correction d'un problème avec des liens et du texte dans les tableaux qui ont été coupés quand réussir un lien
- analyse de site de restriction. Position Les valeurs "Cut (s) "colonne du site de restriction table d'analyse se comporte maintenant comme des numéros au lieu du texte, ce qui signifie de tri et de filtrage des œuvres.
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Un problème avec les paramètres de table enregistrés qui parfois ne fonctionnent a été corrigé. Le correctif de bug comprend une façon plus robuste / générique de l'enregistrement des paramètres de table avec des colonnes différentes. Pour résoudre ce problème, les paramètres existants de table enregistrés doivent d'abord être chargés sur un objet où il travaille (à savoir les mêmes colonnes que quand il a été enregistré); puis les paramètres de la table doivent être enregistrés avec l'ancien nom pour remplacer les paramètres & nbsp;
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Métadonnées pour les arbres phylogénétiques. Un bug a été corrigé & nbsp; avec l'importation de la colonne de métadonnées contenant noms avec deux points.
- Correction d'une erreur lors de l'affichage des traductions des annotations de moins de 3 bases de protéines.
Ce qui est nouveau dans la version 7.5:.
- Les "Workflows" inutilisés bouton a été retiré de la barre d'outils
- Recherche locale activée dans la barre de menu comprend maintenant le filtrage sur "Path".
- le filtrage avancé sur les tables comprend maintenant la possibilité de filtrer un espace, une virgule ou point-virgule listes délimitées des termes.
- les outils de zoom refonte. Le zoom pour fonction de sélection est maintenant également disponible pour les séquences, les listes de séquence, les alignements, et lire mappings
- Sauvegarde / application des paramètres côté du panneau pour les tables travaille maintenant pour différentes tables partager quelques colonnes. & nbsp;.
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opérations de copie peut maintenant être arrêté
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Importer de l'exemple de données et les importations effectuées par le biais des fichiers en faisant glisser dans le plan de travail et en les déposant dans la zone de navigation ne sera plus bloquer l'interface utilisateur lors de l'exécution. Au lieu de cela, l'importation se produit comme un processus d'arrière-plan qui peut être surveillé et contrôlé via l'onglet Processus dans le coin inférieur gauche.
- Etablis CLC prennent désormais en charge les écrans haute résolution tels que Apple Retina affiche de toutes les données indiquées dans la zone de vue (y compris les infobulles).
- de nommage Plus d'information de codage région traductions produites par l'outil Traduire en protéines. Le nom d'une traduction de la région codante constituée par le nom de la séquence d'entrée, suivie par le type d'annotation et, enfin, le nom d'annotation.
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