outil de ligne de commande pour la comparaison de fichiers de données séparés par des virgules utilisant les différences par rapport à déterminer les conformations les plus similaires. Compsortall compare les fichiers de données utilisant la différence relative, calcule un score de similarité, trie les scores de base dans l'ordre croissant (valeurs inférieures représentent une plus grande similitude), enregistre toutes les partitions dans un fichier texte. Les fichiers de données produits par l'utilisateur, doivent être par des virgules fichiers texte délimité. Chaque fichier représente une molécule unique. Chaque ligne dans un fichier représente une conformation unique de la molécule. La première colonne dans le fichier de données doit être une étiquette unique à la conformation représentée par la ligne. Le reste des colonnes sont descripteurs numériques, tels que les mesures spatiales de distance. Les lignes sont comparés combinatoire entre les fichiers. Les étiquettes de comparaison sont enchaînés et enregistrés avec les scores pour l'ensemble de lignes. Cela fournit un moyen d'identifier les conformations qui ont produit un score de similarité donné.
Les travaux futurs comprend:
ajoutant interface GUI
papier poster sur mon pharmacophore 3D algorithme de modélisation
Une version parallèle en utilisant MPI
Quoi de neuf dans cette version:
- sortie d'écran changé pour dernière fusion et écrire cycle plus reflètent fidèlement nombre de lignes fusionnées et écrit.
- Correction d'erreur d'orthographe.
- De légers changements dans le code source commentant et noms de variables pour améliorer la lisibilité
Exigences :.
Mac OS X 10.3
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