MetagenomeDB est une bibliothèque Python conçu pour stocker facilement, d'extraire et d'annoter les séquences métagénomiques & nbsp;. MetagenomeDB agir comme une couche d'abstraction au-dessus d'une base de données MongoDB. Il fournit une...
SSuMMo est une bibliothèque de fonctions conçues autour itérative utilisant hmmer d'attribuer des séquences à des taxons & nbsp;. Les résultats sont très arbres annotées montrant espèces / distribution de genre au sein de cette communauté.Programmes...
tigreBrowser est une expression génique navigateur modèle pour les résultats de package R de tigre (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser nécessite Python version> = 2.5. tigreBrowser peut être...
MACS2 est un modèle basé sur l'outil d'analyse des données de ChIP-Seq.Avec l'amélioration des techniques de séquençage, immunoprécipitation de la chromatine suivie par séquençage à haut débit (ChIP-Seq) devient populaire pour étudier les...
edittag est une collection d'applications pour la conception de jeux de modifier étiquettes de séquences métriques, en vérifiant étiquettes de séquences pour la conformation à l'édition métrique, et l'intégration des étiquettes de séquences à...
MacMolPlt est un programme de graphiques modernes pour tracer structures moléculaires 3-D et des modes normaux (vibrations). Les moyens...
PicMe est un paquet de Python qui contient les programmes d'estimer et de tracer informatif phylogénétique des grands ensembles de données. Installation Pour le moment, la meilleure façon d'installer le programme est:git clone git:...
SyntenyMiner est une application pour visualiser et d'interroger des comparaisons entre plusieurs séquences génomiques complètes. L'interface fournit une vue navigable de matchs à une séquence du génome de référence. Séquence correspond entre les...
ProteinShop est un outil interactif pour manipuler des structures de protéines. Il a été conçu pour créer rapidement un ensemble de configurations de protéines en utilisant la connaissance humaine et de l'intuition. Ces configurations peuvent être...
PySCeS est un projet développé par la Triple J-Groupe pour Molecular Cell Physiology & nbsp;. Pour essayer le modèle et comprendre les processus complexes et les systèmes qui composent la cellule vivante Caractéristiques :. Un texte basé...
