MACS2

MACS2 est un modèle basé sur l'outil d'analyse des données de ChIP-Seq.
Avec l'amélioration des techniques de séquençage, immunoprécipitation de la chromatine suivie par séquençage à haut débit (ChIP-Seq) devient populaire pour étudier les interactions protéine-ADN pangénomique. Pour remédier au manque de force de la méthode d'analyse ChIP-Seq, nous présentons un nouvel algorithme, appelé Analyse des ChIP-Seq (MACS) basé sur un modèle, pour identifier les sites de liaison du facteur de transcription. MACS capture l'influence de la complexité du génome d'évaluer l'importance des régions ChIP enrichis, et MACS améliore la résolution spatiale des sites de liaison en combinant les informations de la fois la position de la balise de séquençage et de l'orientation. . MACS peut être facilement utilisé pour les données de ChIP-Seq seul ou avec l'échantillon de contrôle avec l'augmentation de la spécificité

Exigences :

• Python