Nouveau Bioinformatique Pour Linux
ÉTAPES est un package pour la simulation stochastique exacte des systèmes de réaction-diffusion dans des géométries 3D arbitrairement complexes. Notre algorithme de simulation de base est une implémentation de l'ASS de Gillespie, élargie afin de...
NEO (Neural Ensemble Objects) et est un projet visant à fournir un ensemble commun de classes de base à utiliser dans l'analyse des données de neurones, dans le but d'obtenir OpenElectrophy, et peut-être NeuroTools autres projets avec des...
OpenElectrophy est un cadre pour faciliter la manipulation, le stockage et l'analyse des données électrophysiologiques. Il peut importer des données dans de nombreux formats de fichiers différents et de les stocker dans une base de données unique de...
La tourbe est un ensemble de programmes pour la capture, la prévision et l'analyse des caractéristiques biophysiques des protéines.Voir http://enzyme.ucd.ie/PEAT pour la documentation, des instructions, des captures d'écran, etc. Exigences :. ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) est un programme efficace qui aligne relativement courtes séquences nucléotidiques contre une séquence de référence longue comme le génome humain.Le logiciel met en oeuvre deux algorithmes, bwa-court et BWA-SW. Les anciens...
SSuMMo est une bibliothèque de fonctions conçues autour itérative utilisant hmmer d'attribuer des séquences à des taxons & nbsp;. Les résultats sont très arbres annotées montrant espèces / distribution de genre au sein de cette communauté.Programmes...
gobie est une API Python pour lire les fichiers de données binaires créé en utilisant le cadre de gestion des données Goby next-gen.Normalement, ce répertoire est dans le cadre du paquet de Goby complète, disponible à partir de:& Nbsp; http:...
PySCeS est un projet développé par la Triple J-Groupe pour Molecular Cell Physiology & nbsp;. Pour essayer le modèle et comprendre les processus complexes et les systèmes qui composent la cellule vivante Caractéristiques :. Un texte basé...
Pysam est un module Python pour la lecture et la manipulation Samfiles & nbsp;. Ce est une enveloppe légère de la samtools C-API.Le guide de démarrage rapide est ici. Une documentation plus détaillée est disponible ici.Questions et commentaires sont les...
TRMiner est un utilitaire Python qui vise à conservateurs de données scientifiques. & Nbsp; Il permet de tailler rapidement de grandes collections de publications scientifiques pertinentes à des peines pour un objectif minier donné.Ceci est réalisé en...