LSIM superpose densités électroniques macromoléculaires et calcule un score de similitude structurelle. Les calculs échelle de façon linéaire avec la taille des molécules comparées.
Les alignements sont LSIM liée de façon conceptuelle éléments structurels biochimiques et, par conséquent, ne sont pas biaisées et approprié pour les études protéines similitude de structure seule.
Installation:
Décompressez le fichier de distribution:
LSIM-linux.tar.gz tar
Déplacer vers le répertoire du fichier:
cd lsim.1.0.0
Copier, déplacer ou lier le LSIM de fichier exécutable à un endroit approprié -et assurez LSIM est accessible par l'environnement Variable- PATH, par exemple:
cp LSIM / usr / local / bin
Réglez LSIMDIR variable pour pointer vers le répertoire LSIM choisi, par exemple:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0
Commentaires non trouvées