bint

bint est un logiciel a été écrit dans le but d'obtenir des sous-ensembles de données d'intensité à partir de tests de génotypage & nbsp;. Soit les intensités X & Y pour créer des parcelles de munitions ou Ratio Log R et B allèle fréquences pour la détection CNV.
Extraire les données pour SNP individuelle / CNV marqueurs ou des échantillons individuels était lente grep / awk'ing les fichiers texte exportées du génotypage terme (par exemple Illumina finales des fichiers de rapport).
bint convertit la représentation textuelle des données d'intensité à flotteur dans un fichier binaire indexé IEEE754 pour l'extraction rapide des sous-ensembles de données. En théorie bint pourrait être utilisé pour toutes les grandes tables de données de flotteur.