Arabidopsis Motif Scanner (AMS) est une application Windows qui fonctionne sur les ordinateurs locaux. Il a été développé pour créer des réseaux de gènes en identifiant les positions des éléments cis-régulateurs dans la plante modèle Arabidopsis thaliana et en fournissant une interface facile à évaluer et évaluer les relations génétiques. Sa caractéristique innovante majeure est de combiner les positions des éléments cis-régulatrices, NGS et ADN puce Tableaux de données d'expression, les annotations Arabidopsis et interactions génétiques pour l'identification des réseaux de gènes régulés par des facteurs de transcription. Dans les études ont porté sur la fonction des facteurs de transcription, le logiciel utilise les données d'expression et de motifs de site de liaison dans les régions régulatrices des gènes pour prédire les gènes cibles directes. De plus, AMS utilise des données ADN-protéines et interactions proteinprotein pour faciliter l'identification des voies métaboliques régulées par le facteur de transcription d'intérêt.
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