SigInt

projet de SIGINT est un outil logiciel en ligne de commande qui peut être utilisé pour trouver et classer les protéines de mammifères / gènes qui interagissent spécifiquement et de façon significative avec une liste de protéines / gènes dans le contexte d'un fond signalome mammifères et les réseaux de interactome.
Les entrées au programme sont: (a) une liste de graines de symboles de gènes Entrez gène humain, (b) un fond réseaux en format SIG, et (c) un nom pour le fichier de sortie (page web nom de fichier avec l'extension htm ). SIGINT génère une liste triée des gènes / protéines qui interagissent avec des composants de la liste des semences. Ces composants sont triés par un score z de mesure de la spécificité de ces éléments intermédiaires à coopérer avec les gènes / protéines à partir de la liste des semences.
SIGINT peut être exécuté sur les systèmes d'exploitation Linux, Mac et Windows et il nécessite un réseau fichier texte de fond en format SIG.
Utilisation:
Extraire l'archive
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe