proTRAC

ProTrac est un outil unique et pratique pour la détection probabiliste de cluster piRNA, la visualisation et l'analyse. ProTrac montre une sensibilité plus élevée et la sélectivité par rapport aux méthodes appliquées jusqu'ici de détection de cluster. Séquence L'importance de la séquence observée Lire frappé la densité, de polarisation brin, quantité de loci correspondant à mappé rarement lit, quantité de loci avec T en position 1 ou A en position 10 et le montant de loci dans la gamme de longueur de piRNA typique (26- 32nt) sont prises en compte. Les caractéristiques observées des candidats de cluster sont évalués à la lumière de l'ensemble de données et sont soumis à un système de notation probabiliste.