Serial Cloner

Serial Cloner est un logiciel de biologie moléculaire. Il fournit des outils avec une interface intuitive qui vous assiste dans le clonage de l'ADN, l'analyse des séquences et la visualisation. Serial Cloner a été développé pour fournir un logiciel de biologie moléculaire de lumière pour les utilisateurs Macintosh et Windows. Serial Cloner lit et écrire DNA Strider (tm) des fichiers compatibles avec le standard et les fichiers d'importation et d'exportation dans le format FASTA universelle (ainsi que dans le format pDRAW32). Puissants outils de visualisation graphique et des interfaces simples aident les analyse et de construction étapes (adaptateur, PCR, Gateway [tm] clonage) d'une manière très intuitive. Version 1.3 ajoute désormais une coupe virtuelle, un navigateur web avec l'importation instantanée d'entrées NCBI / EMBL et une carte de restriction silencieuse avec d'autres améliorations.

Ce qui est nouveau dans cette version:

• [NEW] Estimations Point isoélectrique de séquences de protéines (ADN et séquence protéique fenêtre)
• Version [NEW] MacOSX distribué maintenant comme une demande signée (compatibilité Mountain Lion Gatekeeper)
• [Ajouté] Une option dans les Préférences pour sélectionner les tables de valeur pK à utiliser pour pI estimation
• [Ajouté] Une option dans les Préférences d'utiliser le code Codon des tables de l'usage des codons comme un code génétique utilisé pour la traduction
• [Ajouté] Une option dans la fenêtre Restriction de la carte seulement traduire nucléotides qui sont en majuscules
• [Ajouté] Un bouton / menu pour choisir des sites particuliers à afficher dans les cartes de restriction.
• [Ajouté] Analyser les Caractéristiques peptidiques dans des séquences de protéines
• [Ajouté] Hériter Caractéristiques inverse lorsque la traduction d'une séquence d'ADN
• [Ajouté] Un passage rapide entre un ADN et protéines fenêtre Aligner
• [Ajouté] non formaté copie de séquences de protéines (Copiez Plus ... Menu)
• [Ajouté] Hériter Caractéristiques lorsque des séquences copier / coller protéines
• [Ajouté] Caractéristiques d'affichage en protéines Align (Aligner locale)
• [Ajouté] Un bouton à bascule pour mettre en évidence les différences dans les protéines alignées
• [Ajouté] Un raccourci (S) pour montrer rapidement ou masque Caractéristiques (dans l'onglet Caractéristiques de la séquence Windows)
• [Ajouté] 'Anchor' et domaines «noyau» d'amorces sont maintenant reconnus comme fonctionnalités de séquence de Windows
• [Ajouté] Un bouton pour sélectionner rapidement un insert linéaire complète dans la fenêtre «Construire un Construct '
• [Ajouté] Ajout d'un raccourci pour "Copie non formaté» [Commande-Maj-K]
• [Ajouté] Une entrée de menu pour aller à Serial Cloner Forum
• [Ajouté] Une entrée de menu pour aller à Serial Cloner Youtube Channel (tutoriel)
• [Mise à jour] Il est maintenant possible de redimensionner les fenêtres entièrement de séquences
• [Mise à jour] Sites absents sont indiqués en italique dans enzymatiques fenêtres Sélecteur (graphiques et cartes de restriction)
• [Mise à jour] Des sites uniques sont indiqués en gras dans enzymatiques fenêtres Sélecteur (graphiques et cartes de restriction)
• [Mise à jour] Parsing de séquences NCBI (Web Access) de prendre en compte des changements dans les pages NCBI.
• [Mise à jour] Amélioration de l'analyse de séquences contenant 'X' dans la séquence nucléotidique
• [Mise à jour] Changement de raccourci de «Copie Tous séquences Multifasta 'à [Commande-Maj-J] au lieu de [Commande-Maj-K]
• [CORRIGÉ] Un bug d'interface spécifique à Windows la fenêtre "Importer Codon Bias
• [CORRIGÉ] Un bug empêchant parfois copie correcte des images (carte graphique, Cut virtuel, shRNA) dans le presse-papiers (Windows spécifique)
• [CORRIGÉ] Un problème qui se pose avec les noms de RE rares comme R1.BceSIV dans l'enzyme "sélecteur particulier de la carte graphique.
• [CORRIGÉ] Un problème [passerelle Clonage] avec indication des fonctionnalités lorsque le vecteur de destination était antisens (direction de att2-att1)
• [CORRIGÉ] Un bogue dans la sélection de l'AA le plus utilisé lors de la traduction inverse
• [CORRIGÉ] Un problème avec "Sélectionner tout" dans l'ordre et protéines fenêtres
• [CORRIGÉ] Un problème de type de fichier associé à des fichiers de Serial Cloner (casser la compatibilité avec l'importation de Sequencher en particulier)
• [CORRIGÉ] ligature: Parfois produit inutilement dégénérée ADN
• [CORRIGÉ] Passerelle: l'ADN généré mais alors quand puis enregistré comme un type unknown
• [CORRIGÉ] PCR:. Si ce est fait sur "format inconnu" séquence, "protéines" Type généré incorrecte
• [CORRIGÉ] Un problème de mise à jour Feature lors de l'annulation d'une modification
• [CORRIGÉ] Lorsque vous collez une séquence de protéine en format GenBank (NCBI) une fenêtre de séquence de la protéine est maintenant correctement créé.
• [CORRIGÉ] Un problème avec le serveur NCBI BLAST lorsque vous utilisez des caractères non-ASCII dans les noms de séquence
• [CORRIGÉ] Un problème avec l'affichage d'entité après un balayage lorsqu'une seule entité a été trouvé
• [CORRIGÉ] Un problème rare de l'affichage des fonctions dans la fenêtre de Construct
• [CORRIGÉ] Un problème de rafraîchissement lorsque vous utilisez la taille de caractère différent de 12 pt dans les cartes graphiques.
• [CORRIGÉ] Un bogue dans les fenêtres Restriction de carte où la première ligne de la traduction d'acides aminés a été déplacé en mode codon
• [CORRIGÉ] Un bug lié empêcher l'utilisation d'enzymes précédemment sélectionnés dans la fenêtre Cutter virtuel