RAPTOR

RAPTOR est un logiciel innovant conçu pour la prédiction exacte de la structure des protéines. Il combine des outils d'analyse de pointe dans une solution logicielle intégrée et propose trois méthodes de filetage différents. Démarche d'optimisation de programmation entier unique de RAPTOR est le plus efficace pour trouver la structure des modèles de cibles à faible homologie de séquence et est capable de générer des modèles de haute qualité. L'interface facile à utiliser et facile à comprendre les valeurs de E sont idéales pour les débutants et les experts. Surtout, l'affichage intuitif de la sortie permet aux utilisateurs de comprendre les résultats tout simplement un coup d'oeil. Compte tenu d'une séquence de protéine cible, si il ya une protéine homologue à structure 3D connue, il peut être trouvé en utilisant des outils de recherche de séquence comme PSI-BLAST, également prévu dans RAPTOR. La structure de la cible est alors construit à partir de la structure connue; cependant, lorsque l'homologie de séquence est non significatif, soit moins de 25%, PSI-BLAST ne peut pas venir avec un succès confiant. Contrairement PSI-BLAST, qui fait simplement une recherche de séquence, la protéine filetage, pliez la reconnaissance, rend l'usage du homologie et la structure des informations. Il scanne la séquence de la protéine avec une structure inconnue contre une base de données de structures connues. En utilisant une fonction de pointage et la réalisation d'analyses de compatibilité entre les structures tridimensionnelles des protéines et des séquences linéaires, le meilleur modèle structural sera identifié à partir de laquelle pour construire la structure de la séquence. En conséquence, la protéine filetage donne une prévision supérieure à celle de la modélisation par homologie quand il ya homologie de séquence marginale

Limitations :.

Une fonctionnalité limitée