MultiGeneBlast est un outil open source basé sur un reformatage des têtes de FASTA d'entrées de protéines NCBI GenBank, à l'aide duquel il peut traquer leur nucléotide source et coordonnées. MultiGeneBlast peut aider à la détection de ces pièces multigéniques pour les projets de la biologie synthétique. Une bibliothèque d'opérons synthétique peut être créée sur la base de la sortie pour identifier les opérons dont la fonction est plus proche de celui désiré par l'utilisateur. Cet outil fournit les possibilités d'identifier toutes les régions génomiques homologues en combinant les résultats de simple BlastP fonctionne sur chaque gène, et le tri des régions génomiques de toute entrée GenBank par le nombre de hits, la conservation de la synténie, et cumulatif pointage Blast bits. Recherches d'architecture peuvent être effectuées pour trouver des régions génomiques Blast frappe à toute combinaison spécifiée par l'utilisateur des séquences d'acides aminés.
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