GenoSuite est un cadre élaboré pour l'analyse proteogenomic. Stratégie basée FDRScore est utilisé pour intégrer les résultats de plusieurs algorithmes de recherche. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) est développé comme une partie de cadre GenoSuite. PPT est pour trouver de nouvelles traductions dans les génomes procaryotes et dépend de données en fonction de spectrométrie de masse de la protéomique et de la séquence du génome connexe. Les caractéristiques comprennent configurés pour quatre algorithmes open source pour effectuer base de données de recherche pour l'identification de peptide et toute combinaison de l'algorithme 4 peut être choisi, énumère les peptides spécifiques de recherche du génome (peptides roman), matchs spectrales peuvent être visualisées pour l'évaluation de la qualité, énumère les les nouvelles protéines et des changements dans les annotations de protéines existantes, et un contexte génomique visuel des nouveaux peptides peuvent également être générées.
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