Bio-Linux

Bio-Linux est un système d'exploitation open source basé sur le monde & rsquo; s la distribution gratuite la plus populaire de Linux, Ubuntu, construit autour de l'environnement Unité de bureau moderne et conçu à partir du sol pour être utilisé par bioinformaticians.Distributed comme simple, double arc-DVDThe direct distribution peut être téléchargé à partir Softoware comme un seul, double arc en direct des images ISO de DVD d'environ 3 Go de taille, supportant à la fois 64 bits (x86_64) et 32 ​​bits (i386) jeu d'instructions architectures. Il doit être déployé soit à un lecteur flash USB ou un disque DVD afin de démarrer à partir du BIOS d'un optionsBeing de computer.Boot basée sur Ubuntu, il dispose d'un chargeur de démarrage identiques, conçu pour vous permettre d'essayer le système d'exploitation sans avoir à installer quoi que ce soit , commencer directement l'installateur, tester la mémoire vive pour les erreurs, démarrage à partir du premier disque, ainsi que pour vérifier l'intégrité du milieu de démarrage (uniquement si vous utilisez un support DVD) .Modern et l'environnement de travail productif alimenté par UnityAs mentionné, la distribution & rsquo ; s défaut et seul environnement de bureau est l'unité, qui utilise une disposition panneau / dock. Bien que le comité, qui est situé sur la partie supérieure de l'écran, est parfaite pour interagir avec les programmes en cours, la station d'accueil vous aidera à lancer rapidement votre applications.Some préférée des meilleurs bioinformatique open source appsSome des meilleures applications bioinformatiques open source sont inclus dans ce système d'exploitation basé sur Ubuntu, parmi lesquels nous pouvons citer Loi, Arb, Cn3D, Cytoscape, Archaeopteryx, Artemis, BTmapqtl, clustalx, Dendroscope, DDV alignement de séquences Viewer, Entrez, eQTL, Galaxy, Gap4, GAP5, FastQC, Geneious, ggobi, ISACreator, roi, LRmapqtl, mesquite et Jemboss.Bottom lineSumming jusqu'à, Bio-Linux est un système très rapide et productif exploitation basé sur la dernière version d'Ubuntu amont et l'utilisation de l'environnement de bureau GNOME classique, ainsi que certains des meilleures applications bioinformatiques open source

Ce qui est nouveau dans cette version:.

• Résout un problème récent avec le bureau échec de démarrage sur VirtualBox en raison de pilotes incompatibles.
• Mises à jour différents forfaits, notamment des outils QIIME et Bowtie-Bio.
• Ajoute le pandaseq jumelé fin assembleur.
• Ajoute les mises à jour débutants tutoriel spécifique à Linux Bio-8.

Ce qui est nouveau dans la version 8.0.2:

• Nouveau Ubuntu 14.04 système de base prend en charge les derniers matériels et fournit jusqu'à à jour les logiciels de bureautique, multimédia, etc.
• versions mises à jour d'applications bioinformatiques clés comme QIIME, mothur, Jalview, Artemis, BLAST, les outils Bowtie-Bio et bien d'autres (les utilisateurs qui ne met pas ne recevrez plus les mises à jour).
• Up-to-Date versions de nombreux forfaits R, y compris ggplot2, DESeq et déligneuse en plus mis à jour Bioconductor et des milliers d'autres paquets disponibles pour l'installation directe via C2D4U.
• Fourniture de modèles pré-préparés pour une utilisation sur VMWare / VirtualBox.
• Remplacement de NX avec x2go, une version plus flexible du système de bureau à distance rapide et sécurisé.
• Inclusion du bureau MATE comme une alternative plus légère à l'unité.
• Un emballage plus robuste de Galaxy, avec le support de chargement tools Outil-abri, proxy Apache, PostgreSQL automatisé mis en place, l'authentification aux comptes locaux et les téléchargements de fichiers SFTP.
• Un chaton gratuit avec chaque téléchargement!
• ... ok, je ai menti sur le chaton, mais nous avons quelques nouveaux fonds d'écran magnifiques présentés par la communauté des utilisateurs - voir ci-dessous
.

Ce qui est nouveau dans la version 7.0.3:

• Bio-Linux 7 est entièrement comporté, puissant , configurable et facile à entretenir bioinformatique poste de travail. Bio-Linux fournit plus de 500 programmes de bioinformatique sur une base Linux Ubuntu LTS 12.04. Il ya un menu graphique pour les programmes de bioinformatique, ainsi que l'accès facile au système de documentation de la bioinformatique Bio-Linux et des exemples de données utile pour les programmes de test.
• Bio-Linux 7 ajoute de nombreuses améliorations par rapport aux versions précédentes, y compris l'environnement d'analyse Galaxy. Il ya aussi différents forfaits pour gérer les types de données de séquence de nouvelle génération.
• Vous pouvez installer Bio-Linux sur votre machine, soit comme le seul système d'exploitation, ou dans le cadre d'une configuration dual-boot qui vous permet d'utiliser votre système actuel et Bio-Linux sur le même matériel.
• Bio-Linux gère également en direct à partir du DVD ou une clé USB. Cela va dans la mémoire de votre machine et ne implique pas rien installer. Ce est un grand, sans tracas façon d'essayer Bio-Linux, montrer ou enseigner avec elle, ou de travailler avec quand vous êtes en déplacement.
• Bio-Linux est construit sur les systèmes open source et des logiciels, et est donc libre pour installer et à utiliser.