Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere offre une combinaison unique de la littérature-mining et l'analyse de la voie pour les biologistes moléculaires intéressés par la régulation des gènes et des réseaux biologiques.
 BiblioSphere Pathway Edition utilise une base de données complète des relations modélisées individuellement entre les gènes, les protéines, les complexes, les cellules et les tissus ainsi que des techniques minières up-to-date de texte pour l'extraction automatique des connaissances pour vous permettre de lier vos données à des réseaux biologiques dans différents contextes biologiques.
 Utilisez BiblioSphere à

• étendre les réseaux biologiques delà de l'information de la voie canonique (réglementaire et métabolique)
• fusionner vos résultats à haut débit avec des connaissances biologiques et la séquence des analyses fondées
• effectuer contextuelle réglementaire analyse des voies sensibles
• générer variantes spécifiques expérimentation voie
• lien voies à la maladie mécanismes et gènes
• Ne avancée conception expérimentale

Ce qui est nouveau dans cette version:

Nouveau et amélioré sources de données

• Genomatix Expert Curated Gene-Gene Relations:
   Genomatix a intégré sa base de connaissances exclusive des données le commissariat d'experts sur la réglementation du gène dans BiblioSphere. Cette source de données unique ajoute la sémantique des relations gène-gène aux réseaux de gènes BiblioSphere générées dynamiquement, fournissant des informations comme "Gene A active la transcription du gène B» ou «Gene A interagit physiquement avec le gène B".
  
• Voies de transduction du signal:
   Portions de Gene Ontology pertinentes pour la transduction du signal ainsi que des données compilées à partir de la littérature ont été combinés pour permettre l'identification des voies canoniques liés au réseau ciblé.
  
• Voie métabolique associations:
   Associations de voies métaboliques ont été intégrées afin de permettre l'identification d'événements métaboliques pertinentes à votre ensemble de gènes.
  

• Voir avec Pathway experts organisée relations gène-gène
   groupes de gènes sont compilés dans facilement compréhensibles graphiques dynamiques de réseau combinant relations gène-gène main organisée avec des données provenant de l'extraction de connaissances automatisée. Les réseaux peuvent être personnalisés par des filtres et ciblée de manière génétique centrée pour effectuer l'analyse du chemin le plus court.
  
• Voir Localisation cellulaire
   Basé sur les gènes GO annotations sont assignées à leur localisation subcellulaire et visualisé comme une disposition de la cellule schématisé, vous permettant d'identifier les régions sub-cellulaires et les compartiments pertinents pour votre ensemble de gènes.
  

• Gestion de projet: Gérer vos analyses en les organisant dans des dossiers de projet. Accéder rapidement à des résultats précédents avec quelques clics de souris ou ajouter de nouvelles recherches à des projets existants.
  

• Divers petites améliorations et corrections de bugs

Exigences :

• Mac OS X 10.2 ou supérieur
• Java 1.4.1 (mise à jour 1 est recommandé)
• connexion à Internet
• un compte d'évaluation Genomatix (gratuit)