MacVector

        MacVector est une application Macintosh complète qui propose l'édition de séquences, la conception d'amorces, la recherche de bases de données Internet, l'analyse de protéines, la confirmation de séquences, l'alignement de séquences multiples, l'analyse de régions de codage et de nombreuses autres fonctions. MacVector est largement considéré comme le programme le plus intuitif et le plus facile à utiliser pour l'analyse des séquences.
    

Nouveautés dans cette version:

Quelques problèmes mineurs avec Align To Reference lorsque les lectures alignées à partir du dernier résidu de séquences circulaires ont été corrigées.

Nouveautés dans la version 16.0.6:

Quelques problèmes mineurs avec Align To Reference lorsque les lectures alignées à partir du dernier résidu de séquences circulaires ont été corrigées.

Nouveautés dans la version 16.0.2:

Une panne lors de l'appel de la fonction Aligner à la référence Ajouter Seqs sous OS X 10.7 et OS X 10.8 a été corrigée .

Lorsque vous exportez une séquence au format GenBank, MacVector écrit désormais toutes les fonctionnalités de GenBank, même si elles sont actuellement obsolètes.

Nouveautés dans la version 15.5.4:

Le résultat de digestion double de l’enzyme de restriction fonctionne désormais comme prévu lorsque deux ou trois enzymes seulement sont sélectionnées.

Nouveautés dans la version 15.1.4:

La traduction de l'image 3/6 dans l'éditeur de séquence unique maintient maintenant correctement le cadre
après un retour à la ligne.

Un crash lors de l'activation de la traduction de 3/6 frame dans l'éditeur d'alignement de référence avec un
séquence supérieure à 65 000 résidus a été corrigée.

Nouveautés dans la version 15.1.3:

Un bogue dans l'éditeur d'alignement de séquences multiples a été corrigé . L'effet de ce bug était que des résidus supplémentaires apparaissaient parfois au début des séquences lorsqu'ils étaient sauvegardés. Cela n'a affecté que les documents MSA qui ont été modifiés. Si vous vous êtes juste aligné avec ClustalW / Muscle / T-Coffee et enregistré sans modification, les alignements seraient corrects.

Nouveautés dans la version 15.1.1:

Se bloque lors de l'enregistrement de certains alignements de séquences multiples modifiés
(.msan, .msap) les documents ont été résolus.

Un bogue où certaines lectures fastq seraient écrites à plusieurs reprises à partir des résultats d'une recherche Align To Folder a été corrigé.

Nouveautés dans la version 14.5.3:

Un crash occasionnel dans la fonction Aligner sur un dossier a été corrigé.

Un crash rare lors du test de paires d'amorces a été corrigé

Nouveautés dans la version 14.5.2:

Aligner sur un dossier gère désormais correctement les recherches à l'aide d'un segment d'une séquence qui traverse l'origine circulaire.

Activer / Désactiver "Recherche automatique d'ER" dans les Préférences de carte met à jour correctement toutes les fenêtres ouvertes.

Nouveautés dans la version 14.0:

Parallèlement à l’amélioration des performances lorsqu’on utilise des séquences et des alignements de grande taille, des améliorations significatives ont été apportées à la gestion des amorces (notamment la prise en charge des bases de données d’amorçage) et des données NGS.

Nouveautés dans la version 13.5.5:

Un problème où les fonctionnalités de type "????" serait créé lors de l'ouverture d'un fichier enregistré Align To Reference (.axml) résolu.

Nouveautés dans la version 13.5.3:

• L'affichage de l'éditeur Contig s'actualise désormais correctement sous OS X 10.6 lors du chargement d'un alignement enregistré.
• Un plantage a été corrigé dans la boîte à outils d'analyse de protéines.
• Une panne de l'interface Quicktest Primer lors de l'utilisation d'un grand nombre d'enzymes de restriction a été corrigée.

Nouveautés dans la version 13.5.2:

Un problème de défilement dans l'éditeur Contig Editor / Align To Reference a été résolu. Un crash rare lors du réveil sur un autre réseau a été corrigé.

Nouveautés dans la version 13.5.1:

• Sous OS X 10.6, les séquences importées conservent désormais leur nom de fichier d'origine.
• Un crash occasionnel de fermeture de séquences modifiées non sauvegardées a été corrigé.
• Les traductions dans le texte annoté affichent désormais correctement les indicateurs de préférences.
• Certaines incohérences dans la numérotation des séquences "sans titre" ont été résolues.
• Un problème de disparition des fenêtres de séquence sous OS X 10.6 a été résolu,
• Un certain nombre de problèmes d’affichage dans l’éditeur Align To Reference ont été corrigés.
• Un problème où des traductions étaient parfois manquantes dans l'onglet Carte lorsque le zoom sur le niveau de résidu a été corrigé.
• La possibilité d’importer des fichiers BAM dans un projet Assembler a été restaurée.
• Les documents d'alignement multiple des acides nucléiques ont désormais leur propre groupe de couleurs et leurs valeurs par défaut de blocage.
• Les amorces du mode "Test PCR Primer Pair" de Primer Design peuvent désormais dépasser 35 nt.
• Les vues de texte sont désormais automatiquement redimensionnées pour être imprimées sur une seule page.

Nouveautés dans la version 13.5:

L'éditeur de symboles graphiques et la palette graphique flottante ont été réécrits en prévision du passage de MacVector à une architecture 64 bits (avec MacVector 14.0). Les autres améliorations principales visaient à mieux gérer les fichiers NGS (Next Generation Sequencing), en particulier avec la fonctionnalité d’assemblage Align To Folder et Assembler Velvet de novo. Il y a également eu une optimisation du code pour mieux gérer l'analyse de grandes séquences génomiques, particulièrement perceptible avec la fonctionnalité "dot-plot" de Pustell Matrix.