Doit avoir Bioinformatique Pour Linux
ProteinShop est un outil interactif pour manipuler des structures de protéines. Il a été conçu pour créer rapidement un ensemble de configurations de protéines en utilisant la connaissance humaine et de l'intuition. Ces configurations peuvent être...
pyNetConv est une bibliothèque Python créé pour aider à la conversion de certains formats de fichiers réseau.Depuis la version 0.6, pyNetConv est capable de lire / écrire (et de convertir de / à) les formats de fichiers...
Pysam est un module Python pour la lecture et la manipulation Samfiles & nbsp;. Ce est une enveloppe légère de la samtools C-API.Le guide de démarrage rapide est ici. Une documentation plus détaillée est disponible ici.Questions et commentaires sont les...
PySCeS est un projet développé par la Triple J-Groupe pour Molecular Cell Physiology & nbsp;. Pour essayer le modèle et comprendre les processus complexes et les systèmes qui composent la cellule vivante Caractéristiques :. Un texte basé...
reciprocal_smallest_distance est un algorithme de orthologie par paires qui utilise un alignement de séquence global maximum de vraisemblance et la distance évolutive entre les séquences orthologues d'détecte avec précision entre les génomes....
RFLP Planner est un outil qui aide à planifier une expérience de RFLP: Elle trouve des enzymes de restriction qui coupent un ensemble de séquences d'ADN homologues de différentes façons et simule l'image d'électrophorèse sur gel résultant. Le...
Seal est un module Python qui fournit alignement de séquences sur Hadoop.Seal est un des MapReduce demande d'alignement de séquence biologique. Il fonctionne sur Hadoop (http://hadoop.apache.org) à travers Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), une...
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Exigences :
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Construire des systèmes comme marque sont fréquemment utilisées pour créer des workflows complexes, par exemple en bioinformatique. & nbsp; snakemake vise à réduire la complexité de la création de flux de travail en fournissant un domaine spécifique...
SSuMMo est une bibliothèque de fonctions conçues autour itérative utilisant hmmer d'attribuer des séquences à des taxons & nbsp;. Les résultats sont très arbres annotées montrant espèces / distribution de genre au sein de cette communauté.Programmes...