MISO (Mélange des isoformes) est un cadre probabiliste écrit en Python qui quantifie le niveau d'expression & nbsp; de gènes épissage alternatif de l'ARN à partir des données-Seq, et identifie les isoformes ou exons différemment réglementées entre les échantillons.
En modélisant le processus génératif qui lit sont produites à partir isoformes dans l'ARN-Seq, le modèle MISO utilise l'inférence bayésienne pour calculer la probabilité qu'une lecture provient d'une isoforme particulière.
MISO utilise la cession présumée de lit d'isoformes pour quantifier l'abondance de l'ensemble sous-jacent d'isoformes d'ARNm alternatives. Les intervalles de confiance plus estimations peuvent être obtenues, pour quantifier la fiabilité des estimations.
Se il vous plaît voir http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ pour le manuel et la documentation MISO
Exigences :.
- Python
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