Ghemical

Logiciel capture d'écran:
Ghemical
Détails logiciels:
Version: 2.95
Date de transfert: 3 Jun 15
Développeur: TH
Licence: Gratuit
Popularité: 11

Rating: 3.0/5 (Total Votes: 5)

Ghemical est un progiciel de chimie computationnelle publié sous la licence GNU GPL. Cela signifie que le code source complet du paquet est disponible, et les utilisateurs sont libres d'étudier et de modifier l'emballage. Ghemical est écrit en C ++.
Projet Ghemical dispose d'une interface utilisateur graphique (qui est basé sur GNOME), et il prend en charge les deux mécanique quantique (semi-empiriques et ab initio) des modèles et des modèles de mécanique moléculaire (il ya une Tripos champ de force 5.2 comme expérimental pour molécu organique également un outil pour les modèles réduits de protéines [1] est inclus. optimisation de la géométrie, la dynamique moléculaire et d'un grand ensemble d'outils de visualisation sont actuellement disponibles.
Ghemical repose sur le code externe pour fournir les calculs de la mécanique quantique. Méthodes semi-empiriques MNDO, MINDO / 3, AM1 et PM3 proviennent de l'ensemble de mopac7 (domaine public), et sont inclus dans la distribution source.
Le paquet mpqc (GNU GPL) est utilisé pour fournir des méthodes ab initio: les méthodes basées sur la théorie Hartree-Fock sont actuellement pris en charge avec des ensembles de base allant de STO-3G pour 6-31G **.
Le code mpqc ne sont pas inclus dans la distribution source. Pour utiliser l'ab initio base-mpqc méthodes Ghemical, vous devez d'abord compiler et installer le programme de mpqc pour votre système, puis compiler Ghemical utilisant certains paramètres spécifiques qui relient les programmes ensemble; voir le fichier INSTALL pour plus d'informations. Ghemical contient également le paquet OpenBabel pour l'importation et l'exportation de nombreux formats de fichiers différents (ainsi que d'autres tâches).
Installation
Une fois que vous avez téléchargé la dernière version, vous devez extraire tous les fichiers de votre fichier d'archive en utilisant "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz» ou équivalente "gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar". Après cela, s'il vous plaît lire le "INSTALLER" -file vous venez d'extraire pour obtenir des informations supplémentaires.
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